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Para una nueva aplicacion que estamos probando migrar de Tomcat 5.5 a la version 6.0 es necesario subirle la memoria para que trabaje. En tomcat la pila de memoria minima y maxima se configura de la siguiente manera;

export CATALINA_OPTS="-Xms1024m -Xmx1024m"

El comando anterior lo podemos ejecutar desde la consola o agregarlo a tomcat-install/bin/catalina.sh, lo siguiente;

set CATALINA_OPTS=-Xms512m -Xmx512m  (Windows, no "" around the value)
export CATALINA_OPTS="-Xms512m -Xmx512m"  (ksh/bash, "" around the value)
setenv CATALINA_OPTS "-Xms512m -Xmx512m"  (tcsh/csh, "" around the value)

Via | Java Heap Size